Налаштування балалайки потрібно починати з першої струни (найтоншої). Перша струна на балалайці – Ля, друга та третя – Мі. Можна налаштувати балалайку, використовуючи звичайну шестиструнну гітару. Ля на балалайці налаштовується по 5 ладу першої струни гітари.
Першу струну потрібно налаштувати на будь-яку зручну висоту (під голос, під інший музичний інструмент тощо) і до неї підлаштувати інші струни. Для цього слід затиснути середню струну на третьому ладу і за допомогою підтягування досягти унісона з відкритою першою струною.
Звучання відкритих струн балалайки прима утворює її академічний квартово-унісонний буд. Послідовність тонів, починаючи з найнижчої за звучанням струни: EEA.
Як треба сидіти і тримати балалайку під час гри. Лікоть лівої руки під час гри в жодному разі не притискайте до тулуба і не відводьте його надмірно убік. Гриф інструменту повинен лежати трохи нижче за третій суглоб вказівного пальця лівої руки. Долоня лівої руки до грифу інструменту прилягати не повинна.